醫學資訊(Medical Informatic:MI)入門課程:醫學數位內容

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醫學資訊(Medical Informatic:MI)入門課程:醫學數位內容

 

課程目標:

了解常見數位資料格式,熟悉某種臨床專業資料,看得懂資料處理程式範例,會修改範例程式進一步應用。

課程內容:

  1. 程式語言入門: C或JS 入門(含簡易之檔案處理、HTTP、網頁或視窗介面程式)。同學至少學一種程式,看得懂程式語法,可依據課程程式範例做簡單修改及應用
  2. 學會使用工具及程式分析常見之數位資料格式: 配合所學文書處理、數位資料檢視工具、及程式,分析處理常見之數位資料格式。如下: bit、byte、文字及數位資料檔案、XML 及 JSON 結構化文件
  3. 至少熟悉並能處理一種專業的臨床醫學數位內容: 課程將介紹臨床醫療常見的資料,例如電子病歷、醫學影像、生醫訊號、基因序列等臨床醫療產生的資料規格。並以程式範例,分析、處理、網路傳輸、及呈現上述資料
  4. 專題初體驗: 了解某一健康醫療資訊化整合應用情境及其資訊互通架構。配合此情境及架構,修改提供之範例程式,進行某類臨床醫療資料之存取、規格轉換、呈現、或分析處裡

 

報名網址

專題範例:

  1. 設計輸入介面,方便民眾居家輸入血壓、心跳、體溫、血糖等數值,並轉換成醫資標準規格,上傳到健康照護平台
  2. 取得病人最近幾周每天量測的血壓、體溫、血糖等資料,並以表格或圖表呈現,利於醫護人員檢視及說明
  3. 取得標準化醫療平台上之病人基本資料、看診資料、檢驗檢查結果,將資料轉換成 HTML (或 pdf) 文件呈現
  4. 將臨床醫療量測的波形資料(如心電圖MIT ECG EBM ECG 、腦波等)轉換成標準規格,並於視窗或網頁介面中呈現
  5. 參考病理 virtual slide 系統(類似 google map) ,產生縮圖及截圖資訊。配合前端介面縮圖點選座標,呈現大圖部分內容
  6. 依據醫學影像呈現及標記程式範例醫學影像呈現及標記程式範例 ,取得標記座標資訊。設計使用介面,加入標記之解剖或病變說明資訊,轉換成醫資標準規格,上傳到 web 醫學影像平台
  7. 程式處理病變(或不同物種)之NGS 基因序列檢測資料。提供介面如 NGS IGV 範例 ,讓使用者瀏覽及選取特定基因片段,呈現其異變與參考基因的差異狀況(ATGC) 差異狀況